继续教育学院依托上海中医药大学医教研学科优势和雄厚的师资力量，举办各类成人教育，是学校成人教育的专职办学部门和管理机构。下设学历教育中心、非学历教育中心、医学继续教育项目管理中心、学院办公室。

继续教育目前设有夜大学专科、本科、专升本层次的中医学、中药学、中西医临床医学、护理学、康复治疗、营养、公共事业管理等专业；中药学自学考试（专科段、本科段）。我校是中药学专业（专科段、本科段）的成人高等学历继续教育自学考试主考学校。在学历教育方面，形成了以专升本为主，兼顾高中起点本科和专科相结合的多层次办学格局。

非学历教育中心接受上海市卫计委、上海市食品药品监督管理局、上海市劳动人事社会保障局等部门的委托，承担了行业从业人员继续医学教育和执（从）业药师、西医学习中医、护理人员中医药知识技能培训班（基础班、提高班）等继续教育的培训工作。以及面向社会（中医药专业技术人员、中医药爱好者和港澳台同胞）举办多层次多形式的各类中医药知识技能培训班、中医中药防病治病、保健养生知识普及和技能（岗位）培训班，为社会培养了一大批高质量应用型的专门人才。

   学院拥有一支以大学校本部教师及附属医院临床教师为主干的优秀教师队伍，他们的教学经验丰富，理论扎实，临床诊疗水平高，教学效果好；拥有资源丰富的临床教学基地和设施齐备的临床技能实训室。同时，继续教育学院也拥有一支朝气蓬勃、敬业崇德的高素质管理队伍，在工作中不断加强规章制度建设，不断完善教学监控体系，对全过程教学进行严格的管理，保证良好的教学质量和社会声誉。